Suivi Eco-Epidémiologique de la Faune Sauvage Australe et Antarctique
Dernière mise à jour : 18/06/2026
Objectifs
- Acquérir les connaissances de base sur l'intérêt d'approches intégrées utiles pour les suivis des dynamiques éco-épidémiologiques dans les populations d'animaux sauvages en zones polaires.
- Acquérir les réflexes à avoir vis-à-vis de mortalités anormales de la faune sauvage dans le cas de contribution à des suivis de la biodiversité.
- Acquérir les gestes à réaliser pour la collecte de données et échantillons lors de nécropsies d'animaux sauvages (oiseaux en particulier) dans le cadre de suivis éco-épidémiologiques en zones polaires.
- Acquérir les gestes concernant la biosécurité dans des situations de mortalités anormales.
Public visé
- Agents de terrain Volontaire Service Civique de projets de recherche soutenus par l'Institut Polaire Français (IPEV)
- Agents de terrain de la Direction de l'Environnement des Terres Australes et Antarctiques Françaises
- Agents de terrain d'équipe porteuses de projets de recherche soutenu par l'IPEV
- Agents de terrain de l'équipe logistique de l'IPEV
- Agents de terrain de Suivis CNRS SEE-Life incluant une dimension d'éco-épidémiologie
- Etudiant en Ecole vétérinaire ou en stage ou contrat dans un laboratoire de recherche en écologie intéressé par la recherche en éco-épidémiologie
- Doctorants et post-doctorants dans le domaine éco-épidémiologique.
Prérequis
Diplôme d'études supérieures en biologie ou doctorat vétérinaire, et/ou formation en cours en médecine vétérinaire ou écologie.
Maitrise de la langue française (parlé, lu, et écrit).
Programme type
- Formation théorique :
- Maladies infectieuses dans les populations de vertébrés des terres australes et antarctiques : contexte, besoins et démarches mises en place
- Focus sur l'Influenza Aviaire Hautement Pathogène
- L'examen nécropsique : réalisation est contraintes
- Réalisation de prélèvements et conditionnement
- Passage en revue des examens complémentaires faits sur les échantillons prélevés : bactériologie, PCR quantitative/séquençage, sérologie, parasitologie
- Formation pratique (entrainement sur oiseaux sauvages) :
- Atelier examen nécropsique / biosécurité
- Atelier prélèvements pour l'histologie sur cadavres frais intègres et non intègres dans un contexte de circulation de l'influenza aviaire hautement pathogène
Méthodes et modalités pédagogiques
Formation théorique : exposés interactifs assurés par les formateurs (matin ; 9h00-12h30)
Formation pratique : aspects pratiques en salle d'autopsie (après-midi 14h00-18h00)
Moyens et supports pédagogiques
Support des présentations.
Brochure résumant la stratégie de suivi éco-épidémiologique dans les Terres Australes et Antarctiques Françaises.
Fiche d'autopsie adapté au contexte des Terres Australes et Antarctiques Françaises (version imprimée et PDF).
Modalités d'évaluation et de suivi
Profil du / des Formateur(s)
- Thierry Boulinier, Jérémy Tornos et Mathilde Lejeune : Chercheurs et Ingénieurs au CNRS au Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive en écologie des maladies infectieuses, Docteurs vétérinaires et/ou formés à l'expérimentation animale.
- Rozenn Le Net : Intervenante vétérinaire spécialisée en anatomie pathologique.
- Grégory Jouvion : Professeur à l'ENVA en Anatomie pathologique.
La formation bénéficie de l'implication de différentes structures telles que le Centre d'Ecologie
Fonctionnelle et Evolutive ( https://www.cefe.cnrs.fr/fr/ ), le CHUV-faune Sauvage de l'Ecole vétérinaire d'Alfort, la Direction de l'Environnement des Terres Australes et Antarctiques Françaises, la Zone Atelier Terres Australes et Antarctique du CNRS, le suivi CNRS SEE-Life 'ECOPATH' l'OFB/SAGIR et le Réseau National des Echouages/PELAGIS.
Modalités d'admission
L'équipe du CEFE du projet IPEV ECOPATH-1151, la Zone Atelier Terres Australes et Antarctique du CNRS et la Direction de l'Environnement des TAAF prennent en charge les coûts de cette formation, qui concerne principalement les agents effectuant des missions dans les en subantarctique ou Antarctique. 2-5 places sont néanmoins offertes pour des personnes non impliquées dans des missions dans ces zones. Pour candidater, un CV et une lettre de motivation vous seront demandés lors de votre inscription à déposer avant le 5 septembre 2026.